MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 plasmid pI8T7 complete sequence

Total Repeats: 643

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020539	CTA	2	6	39	44	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_020539	AT	3	6	71	76	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020539	GTG	2	6	95	100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020539	TCA	2	6	108	113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_020539	GAA	2	6	168	173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020539	A	6	6	181	186	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020539	TTA	2	6	189	194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020539	TGA	2	6	206	211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	469816324
9	NC_020539	ACAT	2	8	272	279	50 %	25 %	0 %	25 %	469816324
10	NC_020539	TTAAAC	2	12	427	438	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	469816324
11	NC_020539	AAGA	2	8	506	513	75 %	0 %	25 %	0 %	469816324
12	NC_020539	TA	3	6	577	582	50 %	50 %	0 %	0 %	469816324
13	NC_020539	CAT	2	6	638	643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	469816324
14	NC_020539	GCT	2	6	761	766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_020539	TTC	2	6	827	832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_020539	C	6	6	844	849	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
17	NC_020539	TCA	2	6	908	913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	469816325
18	NC_020539	TAG	2	6	941	946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	469816325
19	NC_020539	ATT	2	6	1012	1017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816325
20	NC_020539	CTTA	2	8	1095	1102	25 %	50 %	0 %	25 %	469816325
21	NC_020539	ATC	2	6	1104	1109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	469816325
22	NC_020539	GCA	2	6	1186	1191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	469816325
23	NC_020539	CAT	2	6	1202	1207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	469816325
24	NC_020539	T	7	7	1253	1259	0 %	100 %	0 %	0 %	469816325
25	NC_020539	TGA	2	6	1387	1392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	469816325
26	NC_020539	T	6	6	1460	1465	0 %	100 %	0 %	0 %	469816325
27	NC_020539	AAT	2	6	1473	1478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816325
28	NC_020539	AGTA	2	8	1583	1590	50 %	25 %	25 %	0 %	469816325
29	NC_020539	TTC	2	6	1638	1643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	469816325
30	NC_020539	ATT	2	6	1690	1695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816325
31	NC_020539	TGT	2	6	1711	1716	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	469816325
32	NC_020539	TTC	2	6	1758	1763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	469816325
33	NC_020539	TTC	2	6	1860	1865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	469816325
34	NC_020539	TAGA	2	8	1866	1873	50 %	25 %	25 %	0 %	469816325
35	NC_020539	AC	3	6	1889	1894	50 %	0 %	0 %	50 %	469816325
36	NC_020539	T	6	6	1896	1901	0 %	100 %	0 %	0 %	469816325
37	NC_020539	CCA	2	6	2014	2019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	469816325
38	NC_020539	GC	3	6	2116	2121	0 %	0 %	50 %	50 %	469816325
39	NC_020539	AAT	2	6	2148	2153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816325
40	NC_020539	AGT	2	6	2200	2205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	469816325
41	NC_020539	TCA	2	6	2236	2241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	469816325
42	NC_020539	AGC	2	6	2280	2285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	469816325
43	NC_020539	AC	3	6	2300	2305	50 %	0 %	0 %	50 %	469816325
44	NC_020539	CCAT	2	8	2320	2327	25 %	25 %	0 %	50 %	469816325
45	NC_020539	ATA	2	6	2356	2361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816325
46	NC_020539	ATT	2	6	2392	2397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816325
47	NC_020539	CTT	2	6	2423	2428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	469816325
48	NC_020539	ACA	2	6	2518	2523	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	469816325
49	NC_020539	ATG	2	6	2548	2553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	469816325
50	NC_020539	TCA	2	6	2576	2581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	469816325
51	NC_020539	TCT	2	6	2692	2697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	469816325
52	NC_020539	TAG	2	6	2733	2738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	469816325
53	NC_020539	T	6	6	2763	2768	0 %	100 %	0 %	0 %	469816325
54	NC_020539	TCT	2	6	2785	2790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	469816325
55	NC_020539	TTC	2	6	2889	2894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	469816325
56	NC_020539	TCT	2	6	3040	3045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	469816325
57	NC_020539	CTT	2	6	3084	3089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_020539	ATC	2	6	3107	3112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_020539	TCA	2	6	3131	3136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_020539	CTT	2	6	3162	3167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_020539	ACC	2	6	3179	3184	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_020539	CGTA	2	8	3199	3206	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_020539	ATG	2	6	3208	3213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020539	AC	3	6	3260	3265	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_020539	GTAA	2	8	3289	3296	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020539	TTC	2	6	3391	3396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_020539	A	6	6	3405	3410	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020539	TCTT	2	8	3422	3429	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_020539	ATC	2	6	3439	3444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_020539	TTCA	2	8	3450	3457	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_020539	ATTT	2	8	3461	3468	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020539	TAT	2	6	3474	3479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020539	TCA	2	6	3493	3498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_020539	GCAA	2	8	3500	3507	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_020539	TGAA	2	8	3513	3520	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020539	AAGT	2	8	3529	3536	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020539	AACG	2	8	3561	3568	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_020539	ATA	2	6	3596	3601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020539	AAT	2	6	3617	3622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020539	A	6	6	3628	3633	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020539	TAAA	2	8	3680	3687	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020539	AT	3	6	3711	3716	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020539	ATT	2	6	3721	3726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020539	A	6	6	3743	3748	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020539	TGA	2	6	3786	3791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020539	TAT	2	6	3816	3821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020539	T	6	6	3828	3833	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020539	TA	3	6	3835	3840	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020539	AAAT	2	8	3873	3880	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020539	ATA	2	6	3888	3893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020539	ATA	2	6	3937	3942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020539	ATA	2	6	3949	3954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020539	TATT	2	8	3976	3983	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020539	CAT	2	6	4132	4137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	469816326
95	NC_020539	TTAA	2	8	4206	4213	50 %	50 %	0 %	0 %	469816326
96	NC_020539	TAT	2	6	4228	4233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816326
97	NC_020539	T	6	6	4256	4261	0 %	100 %	0 %	0 %	469816326
98	NC_020539	TTTA	2	8	4295	4302	25 %	75 %	0 %	0 %	469816326
99	NC_020539	AGC	2	6	4316	4321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	469816326
100	NC_020539	T	6	6	4337	4342	0 %	100 %	0 %	0 %	469816326
101	NC_020539	TAATT	2	10	4359	4368	40 %	60 %	0 %	0 %	469816326
102	NC_020539	GTT	2	6	4420	4425	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	469816326
103	NC_020539	T	6	6	4430	4435	0 %	100 %	0 %	0 %	469816326
104	NC_020539	TAT	2	6	4474	4479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816326
105	NC_020539	ATC	2	6	4568	4573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	469816326
106	NC_020539	T	6	6	4589	4594	0 %	100 %	0 %	0 %	469816326
107	NC_020539	TTA	2	6	4602	4607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816326
108	NC_020539	TTGAAG	2	12	4648	4659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	469816326
109	NC_020539	T	8	8	4745	4752	0 %	100 %	0 %	0 %	469816326
110	NC_020539	CAATTA	2	12	4813	4824	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	469816326
111	NC_020539	AAT	2	6	4884	4889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816326
112	NC_020539	TAT	2	6	4920	4925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816327
113	NC_020539	AAG	2	6	4936	4941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	469816327
114	NC_020539	TTA	2	6	4959	4964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816327
115	NC_020539	TTA	2	6	5004	5009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816327
116	NC_020539	T	6	6	5010	5015	0 %	100 %	0 %	0 %	469816327
117	NC_020539	CTT	2	6	5076	5081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	469816327
118	NC_020539	TC	3	6	5113	5118	0 %	50 %	0 %	50 %	469816327
119	NC_020539	TAA	2	6	5129	5134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816327
120	NC_020539	AAT	2	6	5139	5144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816327
121	NC_020539	AAGT	2	8	5162	5169	50 %	25 %	25 %	0 %	469816327
122	NC_020539	CATAA	2	10	5184	5193	60 %	20 %	0 %	20 %	469816327
123	NC_020539	ACC	2	6	5196	5201	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	469816327
124	NC_020539	ATA	2	6	5257	5262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816327
125	NC_020539	TTA	2	6	5290	5295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816327
126	NC_020539	TTA	2	6	5322	5327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816327
127	NC_020539	A	7	7	5374	5380	100 %	0 %	0 %	0 %	469816327
128	NC_020539	GATAC	2	10	5388	5397	40 %	20 %	20 %	20 %	469816327
129	NC_020539	A	8	8	5415	5422	100 %	0 %	0 %	0 %	469816327
130	NC_020539	AT	3	6	5480	5485	50 %	50 %	0 %	0 %	469816327
131	NC_020539	AT	3	6	5537	5542	50 %	50 %	0 %	0 %	469816327
132	NC_020539	TCT	2	6	5605	5610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	469816327
133	NC_020539	TAT	3	9	5612	5620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816327
134	NC_020539	AAAG	2	8	5650	5657	75 %	0 %	25 %	0 %	469816327
135	NC_020539	TAA	2	6	5699	5704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816327
136	NC_020539	TAT	2	6	5741	5746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816327
137	NC_020539	T	6	6	5769	5774	0 %	100 %	0 %	0 %	469816327
138	NC_020539	AT	3	6	5782	5787	50 %	50 %	0 %	0 %	469816327
139	NC_020539	CATT	2	8	5793	5800	25 %	50 %	0 %	25 %	469816327
140	NC_020539	AGA	2	6	5826	5831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	469816327
141	NC_020539	TTAA	2	8	5832	5839	50 %	50 %	0 %	0 %	469816327
142	NC_020539	AAG	2	6	5845	5850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	469816327
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